Создана в марте 1920 года. В апреле преобразована в Морские силы Северного моря. Главная база — г. Архангельск.
Флотилия обеспечивала защиту коммуникаций в Белом море, восточной части Баренцева моря и Арктике, арктических и внутренних морских путей, проводку до Архангельска транспортов из состава внешних конвоев, осуществляла оборону Белого моря, новоземельских проливов, портов и станций Северного морского пути. Корабли флотилии осуществляли минные постановки в Горле Белого моря.
